Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms