Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF248Q8NDW4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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ZNF248Q8NDW4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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ZNF248Q8NDW4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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