Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSAMQ8N6F7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms