Protein–RNA interactions for Protein: Q8N616

LINC00311, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00311, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00311Q8N616 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00311Q8N616 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms