Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC6Q8IVU3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms