Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME9Q86XW9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms