Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37DQ86XT2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms