Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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