Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms