Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms