Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms