Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
LRRC9Q6ZRR7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms