Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIAT1Q6ZQX7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms