Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms