Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE4Q6UWF7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms