Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q6Q795 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q6Q795 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6Q795 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms