Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM88Q6PEY1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms