Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms