Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms