Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms