Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT80Q6KB66 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms