Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms