Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms