Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MYOM3Q5VTT5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms