Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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GFI1BQ5VTD9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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GFI1BQ5VTD9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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GFI1BQ5VTD9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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GFI1BQ5VTD9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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GFI1BQ5VTD9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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