Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP350Q5VT06 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms