Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIF1Q5UIP0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms