Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms