Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGD3Q5JSP0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms