Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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