Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL22Q53GT1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms