Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP20-1Q3LI63 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms