Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRFIP1Q32MZ4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms