Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYSND1Q2T9J0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms