Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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RRN3P1Q2M238 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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RRN3P1Q2M238 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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RRN3P1Q2M238 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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RRN3P1Q2M238 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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RRN3P1Q2M238 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RRN3P1Q2M238 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RRN3P1Q2M238 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RRN3P1Q2M238 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RRN3P1Q2M238 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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