Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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