Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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GEN1Q17RS7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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