Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PTPROQ16827 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PTPROQ16827 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PTPROQ16827 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PTPROQ16827 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PTPROQ16827 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PTPROQ16827 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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PTPROQ16827 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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PTPROQ16827 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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PTPROQ16827 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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PTPROQ16827 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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