Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCK2Q16822 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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