Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
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RTN1Q16799 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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RTN1Q16799 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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RTN1Q16799 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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RTN1Q16799 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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RTN1Q16799 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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RTN1Q16799 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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RTN1Q16799 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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RTN1Q16799 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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RTN1Q16799 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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