Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms