Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FXNQ16595 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FXNQ16595 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FXNQ16595 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FXNQ16595 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FXNQ16595 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FXNQ16595 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FXNQ16595 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FXNQ16595 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FXNQ16595 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FXNQ16595 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FXNQ16595 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FXNQ16595 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FXNQ16595 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FXNQ16595 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FXNQ16595 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FXNQ16595 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FXNQ16595 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FXNQ16595 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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