Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCSK7Q16549 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms