Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
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E2F4Q16254 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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