Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF56Q15929 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms