Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms