Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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