Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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