Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SF1Q15637 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SF1Q15637 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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