Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
ARHGEF6Q15052 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARHGEF6Q15052 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms